O Rio Negro é escuro por ter um leito já definido e pela presença de algas, enquanto o Solimões ainda não formou seu leito, é um rio novo...
Esse fenômeno acontece em decorrência da diferença entre a temperatura e densidade das águas e à velocidade de suas correntezas: o Rio Negro corre cerca de 2 km/h a uma temperatura de 22°C, enquanto que o Rio Solimões corre de 4 a 6 km/h a uma temperatura de 28°C.